Tras un encuentro fortuito con un autoproclamado domador de kaiju, un estudiante de preparatoria se ve arrastrado a un mundo de lucha contra mechas y monstruos.

En un mundo inundado, las naciones forman "Azur Lane" para luchar contra las "Sirenas". Las facciones "Unión", "Real", "Hierro Sangre" y "Imperio Sakura" empuñan buques de guerra antropomorfizados de un "Cubo de Sabiduría".