En el verano de 1989, cuatro niños en Tokio presencian la aparición de la tortuga Gamera, un valiente kaiju que se enfrenta a gigantes monstruos devoradores de humanos.

La alianza terrestre es cada vez más frágil, y Haruo considera pactar con el culto exif. El dilema es claro: la cura podría ser peor que la enfermedad.

En la Tierra, Haruo y compañía hacen contacto con la tribu indígena Houtua. Con el objetivo de derrotar a Godzilla, se dirigen a la vieja instalación de Mechagodzilla.

El solitario y misterioso Killy aparece en una ciudad enorme que se expande y busca eliminar todo rastro de vida. Tiene un destino: salvar lo que queda de la humanidad.

Un estudiante de secundaria descubre que es un Ajin, un ser semihumano. Termina prófugo debido a sus poderes.